保密资格认证是对武器装备科研生产单位的保密基本条件的评价和认可，是经批准的一项涉密行政审批工作，是企事业单位承担涉密武器装备科研生产任务的必要条件。武器装备科研生产单位保密资格分为一级、二级、三级三个等级。一级保密资格单位具备承担绝密级项目科研生产任务的资格；二级保密资格单位具备承担机密级项目科研生产任务的资格；三级保密资格单位具备承担秘密级项目科研生产任务的资格。
涉密认证信息变更：
涉密认证信息变更是指用户对提交的涉密认证信息进行修改。涉密认证的企业相关资质、涉密查询人发生变化时（例如相关证书/人员变更等），应及时到北京中心或其他分中心现场办理变更手续。
变更涉密用户认证所需材料说明：
1.保密资质变更办理所需材料：※所有纸质版材料均须加盖单位公章
（1）《全军武器装备采购信息网用户涉密认证/变更申请表》（模板下载见附件）
（2）经办人身份证原件和复印件
（3）变更证明材料：
①有效期内武器装备科研生产单位保密资格证原件及复印件（如变更原件必需提供）（国家保密局等保密行政管理部门对有效期认定标准另行通知的，按具体通知执行）。
②武器装备科研生产单位保密资格证是企事业单位具备保密资格的证明，鉴于该证办理周期较长，初次申请保密资格或保密资格续审的单位，在保密资格证未正式下发前，可提供保密资格审核认定部门开具的证明原件和复印件（相关说明见附件）。
③有效期内武器装备科研生产许可证复印件（如变更需提供）。
④有效期内装备承制单位资格证复印件（如变更需提供）。
申请流程不同：
保密资质认证包括提交材料、申请受理、书面审查、现场审查、资质授予等阶段
涉密信息系统集成资质认证流程包括提交申请、书面审查、申请受理、现场审查、专家评审和资质授予等5个阶段