预付款保函，其实是履约保函的一种，名称特指预付款而已；有些工程，甲方会预先支付施工单位的开工预付款，但是担心施工单位拿钱不办事，甚至卷款而逃，此时就需要提供预付款保函对甲方的利益进行保障。
预付款保证担保是指由保证人为施工方向业主提供的，保证人对施工方履行扣还预付款义务的保证。以防止施工方在收到业主的预付款后将款项挪作他用或宣布破产等。当施工方在规定的时间内还清预付款项后，业主就需退还预付款保函。
保函是一种专业的术语，他的作用和保证书是相同的。保函是具有法律效力的，还需要缴纳保函费。那么保函手续费的收取标准是什么呢？一、保函的性质
1、是独立于委托人与担保人之间的反担保或委托人与受益人之间的合同或投标条件之外的。
2、是依据其规定的条件生效的，由担保人以保函中规定的任何单据为基础做出决定的。
3、是不可撤销的。
二、保函手续费
境内非融资性保函手续费收取标准：
1、支付保函手续费：
银行为客户开立支付保函业务时，需要向客户征收每季千分之五的保函手续费，指导价为千分之一每季，是500元每季。
2、履约保函手续费：
银行为客户开立履约保函业务时，需要像客户征收每季0.5%的保函手续费，指导价为0.1%，每季度收取500元。
3、投标保函手续费：
银行为客户开立投标保函业务时，需要像客户征收每季0.5%的保函手续费，指导价为0.05%，每季度收取500元。
4、分期付款与延期付款保函手续费：
银行为客户开立分期付款、延期付款保函业务时，均需要像客户征收每季0.5%的保函手续费，指导价为0.15%，每季度收取500元。
5、关税保函手续费：
银行为客户开立关税保函业务时，需要向客户征收每季0.5%的保函手续费，指导价为0.15%，每季度收取500元。
6、租赁保函手续费：
银行为客户开立租赁保函业务时，需要像客户征收每季0.5%的保函手续费，指导价为0.15%，每季度收取1000元。
7、其他保函手续费：
预付款保函、工程质量保函与保释金保函手续费分别为：指导价0.1%、0.1%、0.15%，上限都是0.5%，收费分别是500、500、1000元/季。
预付款保函的作用：
预付款保函既可以有效保障发包方合法权益，又可对承包方提高资本有机工程形成一种激励机制，促使承包方合理配置资金，立足长远，增强企业活力。防止承包方在收到业主的预付款后将款项挪作他用货币宣布破产等。
保函是银行、保险公司、担保公司或个人应申请人的请求，向第三方开立的一种书面信用担保凭证。在建筑工程领域，保函主要有投标保函、履约保函、预付款保函、付款保函。下面对保函业务相关知识及问题和建议进行探讨和分析。
投标保函，是指在招投标中，招标人为保证投标人不得撤销投标文件、中标后不得无正当理由不与招标人订立合同等。要求投标人在递交投标文件时一并提交的由银行出具的书面担保。
概括讲，投标保函的主要目的就是为了为保证投标人权益。
投标人递交了投标保函，在投标中，就得按照规定履行招标文件里的义务：包括在标书规定的期限内，投标人投标后，不得中途撤标、不得修改原报价；投标人中标后，必须与招标人签订合同，并在规定的时间内提供银行的履约保函。
若是投标人未按照要求履行上述义务，则提供担保的银行在受益人提出索赔时，须按照保函规定履行赔偿义务。