专为运输要求保持一定温度的冷冻货或低温货而设计的集装箱。它分为带有冷冻机的内藏式机械冷藏集装箱和没有冷冻机的外置式机械冷藏集装箱。适用装载肉类、水果等货物。冷藏集装箱造价较高，营运费用较高，使用中应注意冷冻装置的技术状态及箱内货物所需的温度。
耗用冷剂式冷藏集装箱
耗用冷剂式冷藏集装箱泛指各种无须外接电源或燃料供应的冷藏集装箱，包括水冰冷藏集装箱、干冰冷藏集装箱、液氮冷藏集装箱、液体空气冷藏集装箱、液体二氧化碳冷藏集装箱、冷板式冷藏集装箱等。耗用冷剂式冷藏集装箱的特点是在运输过程中，不需要外接电源或燃料供应，无任何运动部件，维修保养要求低。主要缺点是无法实现连续制冷，储冷剂放热和消耗后必须重新充冷或补充，较难实现的温度控制，制冷设备占用空间较大。耗用冷剂式冷藏集装箱主要适用于小型冷藏集装箱的短距离运输。耗用冷剂式冷藏集装箱只在区域性短途冷藏运输中尚有使用，而在国际冷藏运输中已无使用并有逐步被淘汰的趋势。
冷藏集装箱运送冻结货时通常使用温度应不高于-18℃。通常英尺冷冻集装箱，平均降温速度为31.3℃ /h（空箱）；但装货后，由于货物热容量较大，降温速度会大大减慢，有时达到设定温度要求需要15-16h。若进货温度较高，则达到设定温度需要2-3d。
根据ISO/TC-104 668 Dimensions and ratings标准的规定，按照集装箱的长度，集装箱可以分为10‘，20’，30‘，40’，45‘，30’集装箱一般不使用，使用多的长度尺寸为20‘和40’的集装箱，而且生产制造的集装箱95%以上为长度40'的集装箱。近几年，45‘集装箱的使用越来越多，所以在2005年换版时把该尺寸的集装箱加入了该标准。